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1.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; ALENCAR, C. M. de; FLORI, J. E. Distribuicao de raizes de pupunha (Bactris gasipae Kunth.) irrigada em Latossolo Vermelho Amarelo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRICOLA, 27., 1998, Pocos de Caldas. Anais... Lavras: UFLA: SBEA, 1998. v.1 p. 58-59.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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2.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; SILVA, J. A. M.; ALENCAR, C. M. de. Estimativa do diâmetro de raízes pelo método do perfil do solo auxiliado pelo processamento de imagens digitais. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUARIA, 2., 1998, São Carlos. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária, 2000. p. 186-189.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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3.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. e. Distribuição radicular da tamareira irrigada em latossolo Vermelho Amarelo. Petrolina: Embrapa Semi-Arido, 1999. 5 p. (Embrapa Semi-Arido. Pesquisa em Andamento, 98).

Biblioteca(s): Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais.

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4.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. C. Distribuição radicular da tamareira irrigada em Latossolo Vermelho Amarelo. Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 1999. 5 p. (Embrapa Semi-Árido. Pesquisa em Andamento, 98).

Biblioteca(s): Embrapa Amapá.

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5.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; FLORI, J. E.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. e. Distribuição de raízes de pupunha irrigada em latossolo Vermelho Amarelo. Petrolina: EMBRAPA-CPATSA, 1999. 4 p. (EMBRAPA-CPATSA. Pesquisa em andamento, 93).

Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amapá; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido; Embrapa Solos; Embrapa Unidades Centrais.

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6.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; FLORI, J. E.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. Distribuiçãoo de raízes de pupunha irrigada em latossolo vermelho amarelo. Petrolina: Embrapa-CPATSA, 1999. 4 p. (Embrapa-CPATSA. Pesquisa em Andamento, 93).

Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.

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7.Imagem marcado/desmarcadoALMEIDA, L. F. P. de; ALENCAR, C. M. de; YAMANISHI, O. K. Propagação por enxertia de atemoia 'Thompson' sobre espécies de Rollinia. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 32, n. 2, p. 653-656, 2010. Também disponível em:

Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.

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8.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; MOURA E SILVA, J. A.; ALENCAR, C. M de; JORGE, L. A. C. Root distribution evaluation by digital image analysis and its comparison with monolith method. In: INTER-REGIONAL CONFERENCE ON ENVIRONMENT-WATER: EMERGING TECHNOLOGIES FOR SUSTAINABLE LAND USE AND WATER MANAGEMENT, 2., Sept. 1999, Lausanne, Switzerland. Trabalho completo. Lausanne: [s.n.], 1999.

Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.

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9.Imagem marcado/desmarcadoALENCAR, C. M. de; ANDRADE, A. R. S. de; CRUZ, R. L.; AZEVEDO, C. A. V. de; GOMES, E. M. Análise de crescimento da alface americana sob três sistemas de irrigação. CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 33., 2004, São Pedro. Anais... Campinas: Faculdade de Engenharia Agrícola da Universidade Estadual de Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2004. CD- ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.

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10.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; ALENCAR, C. M. de; TEIXEIRA, A. H. de C.; SILVA, J. A. M. e. Análise da distribuição radicular da tamareira e da dinâmica da água no solo como subsídio para a profundidade e manejo de irrigação. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 12., 1998, Fortaleza. Agricultura e sustentabilidade no semi-arido: resumos expandidos. Fortaleza: SBCS/UFCE-DCS, 1998. p. 212-213.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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11.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; RESENDE, G. M. de; FLORI, J. E.; SILVA, J. A. M. e; ALENCAR, C. M. de. Distribuição radicular do aspargo em áreas irrigadas de Petrolina-PE. Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 1999. 3 p. (Embrapa Semi-Árido. Comunicado técnico, 84).

Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Hortaliças; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais.

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12.Imagem marcado/desmarcadoBASSOL, L. H.; RESENDE, G. M. de; FLORI, J. E.; SILVA, J. A. M. e; ALENCAR, C. M. de. Distribuição radicular do aspargo em areas irrigadas de Petrolina-PE. Petrolina, PE: Embrapa Semi-Arido, 1999. 3 p. (Embrapa Semi-Arido. Comunicado técnico, 084).

Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.

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13.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; FLORI, J. E.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. e; RAMOS, C. M. C. Distribuicao espacial do sistema radicuar da pupunheira em solos irrigados no Vale do Sao Francisco. Engenharia Agrícola, v. 19 ,n. 2, p. 163-176, set. 1999.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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14.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; SILVA, J. A. M. e; ALENCAR, C. M. de; JORGE, L. A. de C.; HOPMANS, J. W. Digital image analysis of root distribution towards improved irrigation water and soil management: grapevine and date palm study cases. In: ASAE ANNUAL INTERNATIONAL MEETING, 2000, Milwaukee, Wiscosin. Technical paper... St.Joseph: ASAE, 2000. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.

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15.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; SILVA, J. A. M. e; ALENCAR, C. M. de; JORGE, L. A. de C.; HOPMANS, J. W. Digital image analysis of root distribution towards improved irrigation water and soil management: grapevine and date palm study cases. In: ASAE ANNUAL INTERNATIONAL MEETING, 2000, Milwaukee, Wiscosin. Technical paper... St.Joseph: ASAE, 2000. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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16.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. e; TEIXEIRA, A. H. de C. Dinâmica da água em latossolo Vermelho Amarelo cultivado com tamareira: uma orientação para o manejo de irrigação. Petrolina: Embrapa Semiárido, 1999. 7 p. (Embrapa Semiárido. Pesquisa em andamento, 99).

Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais.

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17.Imagem marcado/desmarcadoDINIZ, L. T.; RAMOS, M. L. G.; VIVALDI, L. J.; ALENCAR, C. M. de; JUNQUEIRA, N. T. V. Alterações microbianas e químicas de um gleissolo sob macaubeiras nativas em função da variação sazonal e espacial. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 30, n. 3, p. 750-762, May/June 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.

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18.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; HOPMANS, J. W.; JORGE, L. A. de C.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. e. Grapevine root distribution in drip and microsprinkler irrigation. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 60, n. 2, p. 377-387, abr./jun. 2003.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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19.Imagem marcado/desmarcadoBASSOI, L. H.; HOPMANS, J. W.; JORGE, L. A. de C.; ALENCAR, C. M. de; SILVA, J. A. M. e. Grapevine root distribution in drip and microsprinkler irrigation. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 60, n. 2, p. 377-387, abr./jun. 2003.

Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação.

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20.Imagem marcado/desmarcadoPREZOTTI, L.; HAJI, F. N. P.; HONDA, O. T.; ALENCAR, J. A. de; ALENCAR, C. M. de. Levantamento de parasitoides larvais de Spodoptera frugiperda no Projeto de Irrigacao Bebedouro, em Petrolina, PE. In: SIMPOSIO DE CONTROLE BIOLOGICO-SICONBIOL, 5., 1996, Foz do Iguacu. Anais... Curitiba: EMBRAPA-CNPSo: COBRAFI, 1996. p. 374.

Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.

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Biblioteca(s):  Embrapa Pesca e Aquicultura.
Data corrente:  28/04/2021
Data da última atualização:  28/04/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 2
Autoria:  CORNACINI, M. R.; MANOEL, R. O.; ALCANTARA, M. A. M.; MORAES, M. L. T.; SILVA, E. A. A.; PEREIRA NETO, L. G.; SEBBENN, A. M.; ROSSINI, B. C.; MARINO, C. L.
Afiliação:  MAIARA R. CORNACINI, UNESP, Botucatu-SP; RICARDO O. MANOEL, UNESP, Botucatu-SP; MARCELO A. M. ALCANTARA, UNESP, Botucatu-SP; MARIO L. T. MORAES, UNESP, Ilha Solteira-SP; EDVALDO A. A. SILVA, UNESP, Botucatu-SP; LEONEL GONCALVES PEREIRA NETO, CNPASA; ALEXANDRE M. SEBBENN, INSTITUTO FLORESTAL DE SÃO PAULO, Piracicaba-SP; BRUNO C. ROSSINI, UNESP, Botucatu-SP; CELSO L. MARINO, UNESP, Botucatu-SP.
Título:  Detection and application of novel SSR markers from transcriptome data for Astronium fraxinifolium Schott, a threatened Brazilian tree species.
Ano de publicação:  2021
Fonte/Imprenta:  Molecular Biology Reports, 2021.
ISSN:  0301-4851
DOI:  https://doi.org/10.1007/s11033-021-06338-5
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Astronium fraxinifolium is an endangered tree species from Brazil. Due to its significance in environmental reforestation, as well as the continued exploitation of its wood, it is necessary to develop management programs that support the conservation of the species. Simple sequence repeats (SSR) or microsatellite markers are widely used in population genetic studies across a range of diverse organisms. In this study, we present the first SSR markers developed for A. fraxinifolium as well as their frequency and distribution based on transcriptome data. From transcriptome data, we identified more than 100 thousand sequences presenting microsatellites, with a predominant distribution of trinucleotide repeats. From the initial screening, we selected 20 microsatellite loci which were validated and evaluated for genetic indices in two natural populations. All loci were polymorphic, ranging from four to 11 alleles per locus. The observed and expected heterozygosities ranged from 0 to 1.0 and from 0.533 to 1.0, respectively, while the genetic differentiation (GST = 0.363) was greater within than between populations. The developed SSR loci from RNA-Seq data provides a foundation for future studies on genetic diversity and population structure, mating system, and gene flow for A. fraxinifolium populations and related species, aiming at conservation and management.
Palavras-Chave:  Conservation genetics; Microsatellite markers.
Thesagro:  Anacardiaceae; Astronium Fraxinifolium.
Thesaurus NAL:  Conservation plants; Genetic markers; Microsatellite repeats; Population genetics.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/222904/1/mbr-2021.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPASA1022 - 1UPCAP - DD20212021
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